Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM68Q6AZZ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM68Q6AZZ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM68Q6AZZ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms