Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
RNF123Q5XPI4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
RNF123Q5XPI4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RNF123Q5XPI4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms