Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND4CQ5VZ89 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND4CQ5VZ89 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND4CQ5VZ89 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND4CQ5VZ89 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND4CQ5VZ89 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND4CQ5VZ89 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND4CQ5VZ89 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND4CQ5VZ89 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms