Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLX4IPQ5VYV7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX4IPQ5VYV7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms