Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPATA1Q5VX52 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SPATA1Q5VX52 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPATA1Q5VX52 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPATA1Q5VX52 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms