Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
OBSCNQ5VST9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms