Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRAMEF5Q5TYX0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRAMEF5Q5TYX0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRAMEF5Q5TYX0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRAMEF5Q5TYX0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRAMEF5Q5TYX0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRAMEF5Q5TYX0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRAMEF5Q5TYX0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRAMEF5Q5TYX0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRAMEF5Q5TYX0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRAMEF5Q5TYX0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRAMEF5Q5TYX0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRAMEF5Q5TYX0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF5Q5TYX0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms