Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3BQ5T9A4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD3BQ5T9A4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.6 ms