Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDKL4Q5MAI5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKL4Q5MAI5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms