Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PITRM1Q5JRX3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITRM1Q5JRX3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PITRM1Q5JRX3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PITRM1Q5JRX3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms