Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRDTQ58F21 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRDTQ58F21 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BRDTQ58F21 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRDTQ58F21 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms