Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFTN2Q52LD8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFTN2Q52LD8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFTN2Q52LD8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RFTN2Q52LD8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms