Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
C4orf46Q504U0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4orf46Q504U0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 451.9 ms