Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV1

NBPF20, Neuroblastoma breakpoint family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF20Q3BBV1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF20Q3BBV1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF20Q3BBV1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF20Q3BBV1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF20Q3BBV1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF20Q3BBV1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF20Q3BBV1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NBPF20Q3BBV1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF20Q3BBV1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms