Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY1Q3B7I2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPY1Q3B7I2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms