Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-BQ31612 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HLA-BQ31612 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms