Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSR1Q2NL82 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSR1Q2NL82 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TSR1Q2NL82 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSR1Q2NL82 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms