Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM1Q2NKQ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM1Q2NKQ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SGSM1Q2NKQ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM1Q2NKQ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms