Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF4Q2M2E3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF4Q2M2E3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF4Q2M2E3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms