Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPN21Q16825 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPN21Q16825 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN21Q16825 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
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