Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST3H3Q16695 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIST3H3Q16695 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HIST3H3Q16695 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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