Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
FOXD1Q16676 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
FOXD1Q16676 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
FOXD1Q16676 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FOXD1Q16676 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FOXD1Q16676 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
FOXD1Q16676 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
FOXD1Q16676 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
FOXD1Q16676 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
FOXD1Q16676 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms