Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NREPQ16612 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NREPQ16612 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NREPQ16612 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NREPQ16612 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NREPQ16612 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NREPQ16612 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NREPQ16612 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NREPQ16612 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NREPQ16612 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NREPQ16612 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NREPQ16612 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NREPQ16612 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NREPQ16612 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NREPQ16612 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NREPQ16612 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NREPQ16612 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NREPQ16612 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NREPQ16612 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NREPQ16612 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NREPQ16612 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NREPQ16612 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NREPQ16612 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NREPQ16612 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NREPQ16612 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NREPQ16612 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NREPQ16612 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NREPQ16612 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NREPQ16612 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NREPQ16612 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NREPQ16612 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NREPQ16612 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NREPQ16612 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NREPQ16612 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NREPQ16612 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NREPQ16612 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NREPQ16612 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NREPQ16612 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NREPQ16612 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NREPQ16612 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NREPQ16612 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NREPQ16612 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NREPQ16612 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NREPQ16612 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NREPQ16612 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NREPQ16612 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NREPQ16612 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NREPQ16612 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NREPQ16612 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NREPQ16612 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NREPQ16612 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NREPQ16612 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NREPQ16612 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NREPQ16612 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NREPQ16612 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NREPQ16612 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NREPQ16612 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NREPQ16612 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NREPQ16612 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NREPQ16612 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NREPQ16612 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NREPQ16612 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NREPQ16612 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NREPQ16612 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NREPQ16612 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NREPQ16612 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NREPQ16612 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NREPQ16612 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NREPQ16612 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NREPQ16612 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NREPQ16612 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NREPQ16612 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NREPQ16612 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NREPQ16612 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NREPQ16612 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NREPQ16612 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NREPQ16612 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NREPQ16612 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NREPQ16612 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NREPQ16612 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NREPQ16612 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NREPQ16612 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NREPQ16612 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NREPQ16612 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NREPQ16612 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NREPQ16612 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NREPQ16612 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NREPQ16612 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NREPQ16612 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NREPQ16612 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NREPQ16612 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NREPQ16612 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NREPQ16612 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NREPQ16612 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NREPQ16612 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NREPQ16612 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NREPQ16612 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NREPQ16612 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NREPQ16612 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NREPQ16612 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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