Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SNAPC1Q16533 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAPC1Q16533 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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