Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6AP1Q15904 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6AP1Q15904 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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