Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDSNQ15517 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDSNQ15517 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms