Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELOBQ15370 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELOBQ15370 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELOBQ15370 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELOBQ15370 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELOBQ15370 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELOBQ15370 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ELOBQ15370 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELOBQ15370 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms