Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPAQ15257 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPAQ15257 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPAQ15257 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms