Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDK1Q15118 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDK1Q15118 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PDK1Q15118 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDK1Q15118 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK1Q15118 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDK1Q15118 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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