Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD6Q15008 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD6Q15008 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD6Q15008 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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