Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO1Q147U7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMCO1Q147U7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms