Protein–RNA interactions for Protein: Q14739

LBR, Lamin-B receptor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBRQ14739 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBRQ14739 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LBRQ14739 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LBRQ14739 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LBRQ14739 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LBRQ14739 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBRQ14739 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBRQ14739 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBRQ14739 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBRQ14739 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBRQ14739 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBRQ14739 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBRQ14739 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LBRQ14739 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LBRQ14739 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBRQ14739 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBRQ14739 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LBRQ14739 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LBRQ14739 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LBRQ14739 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LBRQ14739 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LBRQ14739 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LBRQ14739 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LBRQ14739 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LBRQ14739 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LBRQ14739 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LBRQ14739 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LBRQ14739 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LBRQ14739 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LBRQ14739 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LBRQ14739 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LBRQ14739 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LBRQ14739 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LBRQ14739 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LBRQ14739 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LBRQ14739 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LBRQ14739 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LBRQ14739 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LBRQ14739 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LBRQ14739 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LBRQ14739 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LBRQ14739 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LBRQ14739 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LBRQ14739 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LBRQ14739 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LBRQ14739 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LBRQ14739 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LBRQ14739 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBRQ14739 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBRQ14739 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBRQ14739 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBRQ14739 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBRQ14739 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBRQ14739 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBRQ14739 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBRQ14739 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBRQ14739 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBRQ14739 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBRQ14739 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBRQ14739 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBRQ14739 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBRQ14739 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBRQ14739 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBRQ14739 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBRQ14739 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBRQ14739 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBRQ14739 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBRQ14739 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LBRQ14739 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LBRQ14739 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LBRQ14739 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LBRQ14739 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBRQ14739 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBRQ14739 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBRQ14739 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBRQ14739 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBRQ14739 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBRQ14739 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBRQ14739 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBRQ14739 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBRQ14739 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBRQ14739 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBRQ14739 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBRQ14739 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBRQ14739 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBRQ14739 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBRQ14739 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBRQ14739 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBRQ14739 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBRQ14739 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBRQ14739 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBRQ14739 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBRQ14739 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBRQ14739 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBRQ14739 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBRQ14739 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBRQ14739 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBRQ14739 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBRQ14739 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBRQ14739 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 284.1 ms