Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCD11Q14690 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCD11Q14690 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCD11Q14690 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCD11Q14690 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCD11Q14690 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDCD11Q14690 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCD11Q14690 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCD11Q14690 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCD11Q14690 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
PDCD11Q14690 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD11Q14690 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
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