Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX2Q13950 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX2Q13950 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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