Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCINQ13939 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCINQ13939 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCINQ13939 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCINQ13939 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCINQ13939 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCINQ13939 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCINQ13939 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCINQ13939 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCINQ13939 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCINQ13939 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCINQ13939 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCINQ13939 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCINQ13939 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCINQ13939 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCINQ13939 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCINQ13939 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCINQ13939 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCINQ13939 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCINQ13939 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCINQ13939 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCINQ13939 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCINQ13939 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCINQ13939 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCINQ13939 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCINQ13939 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCINQ13939 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCINQ13939 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCINQ13939 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCINQ13939 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCINQ13939 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCINQ13939 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCINQ13939 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCINQ13939 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCINQ13939 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCINQ13939 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCINQ13939 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCINQ13939 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCINQ13939 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCINQ13939 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCINQ13939 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCINQ13939 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCINQ13939 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCINQ13939 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCINQ13939 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCINQ13939 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCINQ13939 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCINQ13939 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCINQ13939 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCINQ13939 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCINQ13939 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCINQ13939 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCINQ13939 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCINQ13939 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCINQ13939 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCINQ13939 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCINQ13939 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCINQ13939 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCINQ13939 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCINQ13939 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCINQ13939 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCINQ13939 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCINQ13939 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCINQ13939 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCINQ13939 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCINQ13939 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCINQ13939 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCINQ13939 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCINQ13939 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCINQ13939 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms