Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCINQ13939 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCINQ13939 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCINQ13939 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCINQ13939 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCINQ13939 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCINQ13939 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCINQ13939 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCINQ13939 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCINQ13939 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCINQ13939 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCINQ13939 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCINQ13939 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCINQ13939 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCINQ13939 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCINQ13939 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCINQ13939 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCINQ13939 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCINQ13939 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCINQ13939 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCINQ13939 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCINQ13939 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCINQ13939 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCINQ13939 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCINQ13939 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCINQ13939 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCINQ13939 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCINQ13939 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCINQ13939 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCINQ13939 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCINQ13939 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCINQ13939 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCINQ13939 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCINQ13939 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCINQ13939 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCINQ13939 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCINQ13939 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCINQ13939 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCINQ13939 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCINQ13939 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCINQ13939 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCINQ13939 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCINQ13939 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCINQ13939 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCINQ13939 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCINQ13939 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCINQ13939 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCINQ13939 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCINQ13939 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCINQ13939 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCINQ13939 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCINQ13939 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCINQ13939 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCINQ13939 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCINQ13939 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCINQ13939 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCINQ13939 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCINQ13939 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCINQ13939 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCINQ13939 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCINQ13939 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCINQ13939 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCINQ13939 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCINQ13939 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCINQ13939 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCINQ13939 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCINQ13939 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCINQ13939 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCINQ13939 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCINQ13939 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCINQ13939 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCINQ13939 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCINQ13939 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCINQ13939 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
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