Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLD1Q13393 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLD1Q13393 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLD1Q13393 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PLD1Q13393 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLD1Q13393 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLD1Q13393 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PLD1Q13393 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLD1Q13393 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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PLD1Q13393 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
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PLD1Q13393 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
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PLD1Q13393 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
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PLD1Q13393 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
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PLD1Q13393 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
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PLD1Q13393 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLD1Q13393 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLD1Q13393 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLD1Q13393 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLD1Q13393 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLD1Q13393 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLD1Q13393 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLD1Q13393 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PLD1Q13393 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
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