Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SP140Q13342 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP140Q13342 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP140Q13342 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP140Q13342 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP140Q13342 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP140Q13342 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP140Q13342 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP140Q13342 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP140Q13342 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP140Q13342 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP140Q13342 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP140Q13342 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP140Q13342 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SP140Q13342 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP140Q13342 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP140Q13342 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP140Q13342 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP140Q13342 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP140Q13342 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP140Q13342 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP140Q13342 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP140Q13342 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP140Q13342 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP140Q13342 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP140Q13342 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP140Q13342 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SP140Q13342 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP140Q13342 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP140Q13342 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP140Q13342 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SP140Q13342 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP140Q13342 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP140Q13342 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP140Q13342 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP140Q13342 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP140Q13342 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SP140Q13342 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP140Q13342 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP140Q13342 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP140Q13342 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP140Q13342 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SP140Q13342 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP140Q13342 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP140Q13342 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP140Q13342 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SP140Q13342 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP140Q13342 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP140Q13342 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP140Q13342 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP140Q13342 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP140Q13342 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP140Q13342 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP140Q13342 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP140Q13342 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP140Q13342 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP140Q13342 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP140Q13342 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP140Q13342 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP140Q13342 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP140Q13342 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP140Q13342 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP140Q13342 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP140Q13342 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP140Q13342 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP140Q13342 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP140Q13342 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP140Q13342 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP140Q13342 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP140Q13342 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP140Q13342 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP140Q13342 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP140Q13342 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP140Q13342 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP140Q13342 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP140Q13342 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP140Q13342 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP140Q13342 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140Q13342 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140Q13342 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140Q13342 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140Q13342 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140Q13342 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140Q13342 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140Q13342 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140Q13342 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140Q13342 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140Q13342 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140Q13342 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SP140Q13342 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP140Q13342 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP140Q13342 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP140Q13342 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP140Q13342 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP140Q13342 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SP140Q13342 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP140Q13342 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP140Q13342 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP140Q13342 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP140Q13342 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
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