Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTK7Q13308 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTK7Q13308 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTK7Q13308 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTK7Q13308 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTK7Q13308 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTK7Q13308 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTK7Q13308 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTK7Q13308 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTK7Q13308 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTK7Q13308 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PTK7Q13308 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTK7Q13308 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTK7Q13308 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTK7Q13308 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTK7Q13308 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTK7Q13308 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTK7Q13308 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTK7Q13308 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTK7Q13308 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTK7Q13308 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTK7Q13308 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTK7Q13308 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTK7Q13308 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTK7Q13308 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTK7Q13308 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTK7Q13308 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms