Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWF1Q12792 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TWF1Q12792 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TWF1Q12792 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWF1Q12792 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWF1Q12792 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWF1Q12792 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TWF1Q12792 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWF1Q12792 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWF1Q12792 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWF1Q12792 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TWF1Q12792 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWF1Q12792 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWF1Q12792 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWF1Q12792 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWF1Q12792 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
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