Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CGNL1Q0VF96 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CGNL1Q0VF96 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CGNL1Q0VF96 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CGNL1Q0VF96 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CGNL1Q0VF96 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CGNL1Q0VF96 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CGNL1Q0VF96 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CGNL1Q0VF96 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CGNL1Q0VF96 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CGNL1Q0VF96 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CGNL1Q0VF96 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CGNL1Q0VF96 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CGNL1Q0VF96 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms