Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC41.02■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC41■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC40.99■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.15
GOLGA3Q08378 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC40.9■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
GOLGA3Q08378 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40.88■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
GOLGA3Q08378 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
GOLGA3Q08378 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.74■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
GOLGA3Q08378 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms