Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 YOL107WYOL107W 1029 nt7.38□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 ALG5YPL227C 1005 nt7.38□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 NDE2YDL085W 1638 nt7.38□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 MUM3YOR298W 1440 nt7.37□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 AAT1YKL106W 1356 nt7.37□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 YKR104WYKR104W 921 nt7.37□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 AGP2YBR132C 1791 nt7.37□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 VBA5YKR105C 1749 nt7.37□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 ERR3YMR323W 1314 nt7.36□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 ERR1YOR393W 1314 nt7.36□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 ERR2YPL281C 1314 nt7.36□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 PET18YCR020C 648 nt7.36□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 FSH1YHR049W 732 nt7.36□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 HEM15YOR176W 1182 nt7.36□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 HTS1YPR033C 1641 nt7.36□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 YCR006CYCR006C 474 nt7.35□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 RMD5YDR255C 1266 nt7.35□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 YGR066CYGR066C 879 nt7.35□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 TDH1YJL052W 999 nt7.35□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 PHA2YNL316C 1005 nt7.35□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 TMS1YDR105C 1422 nt7.35□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 AQR1YNL065W 1761 nt7.34□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.34□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.34□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.34□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.34□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.34□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 ATP6Q0085 780 nt7.34□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 GTT3YEL017W 1014 nt7.34□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 TIF2YJL138C 1188 nt7.34□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 TIF1YKR059W 1188 nt7.34□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 YLR198CYLR198C 360 nt7.34□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 YMR253CYMR253C 1245 nt7.34□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 MTQ1YNL063W 945 nt7.34□□□□□ -1.23
AVO1Q08236 SAM50YNL026W 1455 nt7.33□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YCP4YCR004C 744 nt7.33□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YGR210CYGR210C 1236 nt7.33□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YJL009WYJL009W 327 nt7.33□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 UBS1YBR165W 834 nt7.33□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 FRE5YOR384W 2085 nt7.32□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 HSV2YGR223C 1347 nt7.32□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 RKM4YDR257C 1485 nt7.32□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YGR283CYGR283C 1026 nt7.32□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YJR149WYJR149W 1215 nt7.32□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 FET4YMR319C 1659 nt7.32□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 RTG3YBL103C 1461 nt7.31□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YDL241WYDL241W 372 nt7.31□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 TRP4YDR354W 1143 nt7.31□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 QCR6YFR033C 444 nt7.31□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YHR054CYHR054C 1065 nt7.31□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YIR035CYIR035C 765 nt7.31□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 VTA1YLR181C 993 nt7.31□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YNL194CYNL194C 906 nt7.31□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YOL024WYOL024W 519 nt7.31□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt7.31□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 TRP2YER090W 1524 nt7.31□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 FET5YFL041W 1869 nt7.3□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 SLM3YDL033C 1254 nt7.3□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 RAM1YDL090C 1296 nt7.3□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YDL129WYDL129W 876 nt7.3□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 EAF5YEL018W 840 nt7.3□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 JJJ3YJR097W 519 nt7.3□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 ERG6YML008C 1152 nt7.3□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 MRP7YNL005C 1116 nt7.3□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 FCY1YPR062W 477 nt7.3□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 ARO10YDR380W 1908 nt7.3□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 snR86snR86 1004 nt7.29□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 SWM1YDR260C 513 nt7.29□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 CHS7YHR142W 951 nt7.29□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 EMC3YKL207W 762 nt7.29□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 BUB2YMR055C 921 nt7.29□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 PRM4YPL156C 855 nt7.29□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YIL177CYIL177C 5277 nt7.28□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YGR291CYGR291C 222 nt7.28□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt7.28□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 ERG12YMR208W 1332 nt7.27□□□□□ -1.24
AVO1Q08236 RTN1YDR233C 888 nt7.27□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.27□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 LIP2YLR239C 987 nt7.27□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 ERV41YML067C 1059 nt7.27□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 YMR166CYMR166C 1107 nt7.27□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 ARC35YNR035C 1029 nt7.27□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 YPL108WYPL108W 507 nt7.27□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 ECM2YBR065C 1095 nt7.27□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 GYP8YFL027C 1494 nt7.27□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 RPN5YDL147W 1338 nt7.27□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 HER2YMR293C 1395 nt7.26□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 MPC54YOR177C 1395 nt7.26□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 YPL245WYPL245W 1365 nt7.26□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 YGR011WYGR011W 327 nt7.26□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 SNF7YLR025W 723 nt7.26□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 RSF1YMR030W 1131 nt7.26□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 MRPS8YMR158W 468 nt7.26□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 RNH1YMR234W 1047 nt7.26□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 PCL1YNL289W 840 nt7.26□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 MET22YOL064C 1074 nt7.26□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 ORT1YOR130C 879 nt7.26□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 SSP2YOR242C 1116 nt7.26□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 OLA1YBR025C 1185 nt7.26□□□□□ -1.25
AVO1Q08236 snR189snR189 189 nt7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.9 ms