Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP1Q07960 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGAP1Q07960 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP1Q07960 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms