Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FMODQ06828 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FMODQ06828 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FMODQ06828 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FMODQ06828 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FMODQ06828 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FMODQ06828 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FMODQ06828 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FMODQ06828 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FMODQ06828 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FMODQ06828 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMODQ06828 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMODQ06828 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMODQ06828 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMODQ06828 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMODQ06828 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMODQ06828 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMODQ06828 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMODQ06828 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMODQ06828 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FMODQ06828 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMODQ06828 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMODQ06828 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMODQ06828 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMODQ06828 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMODQ06828 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMODQ06828 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMODQ06828 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMODQ06828 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMODQ06828 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMODQ06828 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMODQ06828 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMODQ06828 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMODQ06828 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMODQ06828 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMODQ06828 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMODQ06828 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMODQ06828 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMODQ06828 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FMODQ06828 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMODQ06828 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FMODQ06828 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FMODQ06828 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMODQ06828 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMODQ06828 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMODQ06828 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMODQ06828 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMODQ06828 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMODQ06828 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMODQ06828 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMODQ06828 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMODQ06828 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMODQ06828 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FMODQ06828 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMODQ06828 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMODQ06828 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMODQ06828 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMODQ06828 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMODQ06828 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMODQ06828 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMODQ06828 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMODQ06828 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FMODQ06828 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FMODQ06828 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FMODQ06828 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FMODQ06828 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FMODQ06828 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FMODQ06828 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FMODQ06828 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FMODQ06828 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FMODQ06828 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FMODQ06828 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FMODQ06828 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FMODQ06828 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FMODQ06828 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FMODQ06828 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FMODQ06828 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FMODQ06828 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FMODQ06828 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FMODQ06828 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FMODQ06828 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FMODQ06828 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FMODQ06828 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FMODQ06828 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FMODQ06828 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FMODQ06828 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FMODQ06828 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FMODQ06828 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FMODQ06828 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FMODQ06828 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FMODQ06828 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FMODQ06828 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FMODQ06828 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FMODQ06828 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FMODQ06828 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FMODQ06828 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FMODQ06828 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FMODQ06828 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FMODQ06828 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FMODQ06828 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms