Protein–RNA interactions for Protein: Q05DH4

FAM160A1, Protein FAM160A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM160A1Q05DH4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM160A1Q05DH4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FAM160A1Q05DH4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM160A1Q05DH4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM160A1Q05DH4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM160A1Q05DH4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM160A1Q05DH4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms