Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DEUP1Q05D60 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DEUP1Q05D60 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DEUP1Q05D60 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms