Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRSF11Q05519 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF11Q05519 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF11Q05519 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms