Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
TOP2BQ02880 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
TOP2BQ02880 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC42.4■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
TOP2BQ02880 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC42.36■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
TOP2BQ02880 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC42.29■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC42.28■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
TOP2BQ02880 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
TOP2BQ02880 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms