Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NHLH1Q02575 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NHLH1Q02575 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHLH1Q02575 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms