Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRKCEQ02156 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKCEQ02156 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKCEQ02156 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKCEQ02156 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKCEQ02156 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCEQ02156 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms